Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ22

RAB12, Ras-related protein Rab-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB12Q6IQ22 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB12Q6IQ22 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB12Q6IQ22 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB12Q6IQ22 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms