Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RTL6Q6ICC9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RTL6Q6ICC9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
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