Protein–RNA interactions for Protein: Q6A162

KRT40, Keratin, type I cytoskeletal 40, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT40Q6A162 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KRT40Q6A162 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT40Q6A162 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT40Q6A162 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT40Q6A162 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT40Q6A162 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT40Q6A162 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KRT40Q6A162 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT40Q6A162 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT40Q6A162 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KRT40Q6A162 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KRT40Q6A162 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT40Q6A162 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT40Q6A162 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT40Q6A162 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT40Q6A162 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT40Q6A162 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT40Q6A162 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT40Q6A162 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT40Q6A162 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT40Q6A162 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT40Q6A162 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT40Q6A162 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT40Q6A162 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT40Q6A162 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT40Q6A162 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT40Q6A162 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms