Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXT5

SYPL2, Synaptophysin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL2Q5VXT5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYPL2Q5VXT5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYPL2Q5VXT5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYPL2Q5VXT5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYPL2Q5VXT5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYPL2Q5VXT5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYPL2Q5VXT5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYPL2Q5VXT5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYPL2Q5VXT5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYPL2Q5VXT5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYPL2Q5VXT5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYPL2Q5VXT5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYPL2Q5VXT5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYPL2Q5VXT5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYPL2Q5VXT5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYPL2Q5VXT5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYPL2Q5VXT5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SYPL2Q5VXT5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms