Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANKRD55Q3KP44 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANKRD55Q3KP44 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANKRD55Q3KP44 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANKRD55Q3KP44 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ANKRD55Q3KP44 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ANKRD55Q3KP44 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ANKRD55Q3KP44 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD55Q3KP44 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms