Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
FOXD1Q16676 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
FOXD1Q16676 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
FOXD1Q16676 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
FOXD1Q16676 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
FOXD1Q16676 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
FOXD1Q16676 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
FOXD1Q16676 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
FOXD1Q16676 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
FOXD1Q16676 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
FOXD1Q16676 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
FOXD1Q16676 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
FOXD1Q16676 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
FOXD1Q16676 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
FOXD1Q16676 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
FOXD1Q16676 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
FOXD1Q16676 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
FOXD1Q16676 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
FOXD1Q16676 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
FOXD1Q16676 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.93■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
FOXD1Q16676 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
FOXD1Q16676 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
FOXD1Q16676 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
FOXD1Q16676 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
FOXD1Q16676 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
FOXD1Q16676 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
FOXD1Q16676 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
FOXD1Q16676 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
FOXD1Q16676 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
FOXD1Q16676 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
FOXD1Q16676 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
FOXD1Q16676 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
FOXD1Q16676 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
FOXD1Q16676 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
FOXD1Q16676 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
FOXD1Q16676 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
FOXD1Q16676 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
FOXD1Q16676 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
FOXD1Q16676 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
FOXD1Q16676 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
FOXD1Q16676 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
FOXD1Q16676 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
FOXD1Q16676 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
FOXD1Q16676 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
FOXD1Q16676 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
FOXD1Q16676 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
FOXD1Q16676 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
FOXD1Q16676 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
FOXD1Q16676 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.82■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
FOXD1Q16676 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
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