Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NCAPHQ15003 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NCAPHQ15003 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCAPHQ15003 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
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