Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XRCC4Q13426 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XRCC4Q13426 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XRCC4Q13426 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
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