Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IFT88Q13099 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT88Q13099 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IFT88Q13099 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
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