Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXD4Q12950 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4Q12950 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4Q12950 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms