Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCB1Q12824 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCB1Q12824 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCB1Q12824 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCB1Q12824 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCB1Q12824 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMARCB1Q12824 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCB1Q12824 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCB1Q12824 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCB1Q12824 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCB1Q12824 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCB1Q12824 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCB1Q12824 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCB1Q12824 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCB1Q12824 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCB1Q12824 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCB1Q12824 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMARCB1Q12824 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCB1Q12824 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCB1Q12824 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCB1Q12824 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCB1Q12824 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMARCB1Q12824 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCB1Q12824 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCB1Q12824 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCB1Q12824 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCB1Q12824 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMARCB1Q12824 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMARCB1Q12824 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMARCB1Q12824 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
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