Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C2orf54Q08AI8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
C2orf54Q08AI8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 226.3 ms