Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP3CAQ08209 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP3CAQ08209 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPP3CAQ08209 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP3CAQ08209 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP3CAQ08209 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP3CAQ08209 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP3CAQ08209 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP3CAQ08209 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP3CAQ08209 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP3CAQ08209 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP3CAQ08209 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP3CAQ08209 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP3CAQ08209 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPP3CAQ08209 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP3CAQ08209 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP3CAQ08209 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP3CAQ08209 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP3CAQ08209 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP3CAQ08209 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP3CAQ08209 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP3CAQ08209 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP3CAQ08209 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP3CAQ08209 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPP3CAQ08209 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPP3CAQ08209 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PPP3CAQ08209 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms