Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB3Q05901 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHRNB3Q05901 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNB3Q05901 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms