Protein–RNA interactions for Protein: Q03790

NUP53, Nucleoporin NUP53, yeastyeast

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP53Q03790 COA2YPL189C-A 207 nt5.41□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 ATG12YBR217W 561 nt5.41□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 RSC30YHR056C 2652 nt5.41□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 CEF1YMR213W 1773 nt5.41□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 NOP7YGR103W 1818 nt5.41□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 PUF3YLL013C 2640 nt5.41□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 CCC2YDR270W 3015 nt5.4□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 MRK1YDL079C 1506 nt5.4□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.4□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 MPC1YGL080W 393 nt5.4□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.4□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 DMA1YHR115C 1251 nt5.4□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 CIN4YMR138W 576 nt5.4□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 COX5AYNL052W 462 nt5.4□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 RDL2YOR286W 450 nt5.4□□□□□ -1.54
NUP53Q03790 YPR204WYPR204W 3099 nt5.4□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 HST3YOR025W 1344 nt5.4□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 COR1YBL045C 1374 nt5.4□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 SEC18YBR080C 2277 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 COX20YDR231C 618 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 THI4YGR144W 981 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 SSP120YLR250W 705 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 ELA1YNL230C 1140 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 AAD15YOL165C 432 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 DAP1YPL170W 459 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 HIS7YBR248C 1659 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 ACS1YAL054C 2142 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 CHL4YDR254W 1377 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 SRP101YDR292C 1866 nt5.39□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 PYK2YOR347C 1521 nt5.38□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 RAD24YER173W 1980 nt5.38□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 YPR114WYPR114W 948 nt5.38□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 SIT1YEL065W 1887 nt5.38□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 YIL055CYIL055C 1884 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 RHB1YCR027C 630 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 YHR140WYHR140W 720 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 RPR2YIR015W 435 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 RPL21AYBR191W 483 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 TPO3YPR156C 1869 nt5.37□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 TMT1YER175C 900 nt5.36□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 SUA5YGL169W 1281 nt5.36□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 RAI1YGL246C 1164 nt5.36□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 BCY1YIL033C 1251 nt5.36□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 HAP3YBL021C 435 nt5.36□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 GLN1YPR035W 1113 nt5.36□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 PRE2YPR103W 864 nt5.36□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 ECM7YLR443W 1347 nt5.36□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 ATG18YFR021W 1503 nt5.36□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 YIL092WYIL092W 1902 nt5.35□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 AFG1YEL052W 1530 nt5.35□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 SES1YDR023W 1389 nt5.35□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 YGL072CYGL072C 360 nt5.35□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 CCP1YKR066C 1086 nt5.35□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 MRPL24YMR193W 777 nt5.35□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 DSE3YOR264W 1293 nt5.35□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 CDC10YCR002C 969 nt5.34□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 TRP1YDR007W 675 nt5.34□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 GUS1YGL245W 2127 nt5.34□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt5.34□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 YMR114CYMR114C 1107 nt5.34□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 MRPL22YNL177C 930 nt5.34□□□□□ -1.55
NUP53Q03790 PGM1YKL127W 1713 nt5.34□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 SKI2YLR398C 3864 nt5.33□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 ARP3YJR065C 1350 nt5.33□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 MDH3YDL078C 1032 nt5.33□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 CTF8YHR191C 402 nt5.33□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 UBC11YOR339C 471 nt5.33□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 RAP1YNL216W 2484 nt5.33□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 DDC1YPL194W 1839 nt5.32□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 YTP1YNL237W 1380 nt5.32□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 SNF11YDR073W 510 nt5.32□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 ASN1YPR145W 1719 nt5.31□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 ECM38YLR299W 1983 nt5.31□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 YMR155WYMR155W 1644 nt5.31□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 VMS1YDR049W 1899 nt5.31□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.31□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.31□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.31□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.31□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.31□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 PEX12YMR026C 1200 nt5.31□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 YNR048WYNR048W 1182 nt5.31□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 YBR144CYBR144C 315 nt5.31□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 GUD1YDL238C 1470 nt5.31□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 RIO1YOR119C 1455 nt5.31□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 AVO1YOL078W 3531 nt5.31□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 HRQ1YDR291W 3234 nt5.31□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 BDF2YDL070W 1917 nt5.31□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 IMA2YOL157C 1770 nt5.3□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 YGL235WYGL235W 537 nt5.3□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 RDL1YOR285W 420 nt5.3□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 ECM2YBR065C 1095 nt5.3□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 ATG4YNL223W 1485 nt5.3□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 VHT1YGR065C 1782 nt5.29□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 ALT2YDR111C 1524 nt5.29□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 YGR022CYGR022C 330 nt5.29□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 YLR036CYLR036C 612 nt5.29□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.29□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 BSC4YNL269W 396 nt5.29□□□□□ -1.56
NUP53Q03790 YOL079WYOL079W 399 nt5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.6 ms