Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC25A11Q02978 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC25A11Q02978 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC25A11Q02978 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms