Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IRF8Q02556 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IRF8Q02556 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
IRF8Q02556 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms