Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MUC3AQ02505 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MUC3AQ02505 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MUC3AQ02505 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms