Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EXOSC10Q01780 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EXOSC10Q01780 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EXOSC10Q01780 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EXOSC10Q01780 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EXOSC10Q01780 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EXOSC10Q01780 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EXOSC10Q01780 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EXOSC10Q01780 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
EXOSC10Q01780 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EXOSC10Q01780 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EXOSC10Q01780 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EXOSC10Q01780 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EXOSC10Q01780 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EXOSC10Q01780 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EXOSC10Q01780 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EXOSC10Q01780 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EXOSC10Q01780 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EXOSC10Q01780 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EXOSC10Q01780 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EXOSC10Q01780 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EXOSC10Q01780 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EXOSC10Q01780 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EXOSC10Q01780 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EXOSC10Q01780 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EXOSC10Q01780 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EXOSC10Q01780 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EXOSC10Q01780 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EXOSC10Q01780 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EXOSC10Q01780 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EXOSC10Q01780 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EXOSC10Q01780 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms