Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2BQ00403 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2BQ00403 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GTF2BQ00403 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms