Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL8P80075 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL8P80075 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL8P80075 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL8P80075 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL8P80075 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL8P80075 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL8P80075 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL8P80075 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL8P80075 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL8P80075 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL8P80075 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL8P80075 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL8P80075 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL8P80075 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL8P80075 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL8P80075 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL8P80075 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL8P80075 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL8P80075 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL8P80075 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCL8P80075 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL8P80075 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL8P80075 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL8P80075 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL8P80075 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL8P80075 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL8P80075 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL8P80075 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL8P80075 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCL8P80075 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCL8P80075 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL8P80075 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL8P80075 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL8P80075 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCL8P80075 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL8P80075 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL8P80075 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL8P80075 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL8P80075 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL8P80075 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL8P80075 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL8P80075 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL8P80075 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL8P80075 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL8P80075 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL8P80075 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL8P80075 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL8P80075 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCL8P80075 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL8P80075 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL8P80075 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL8P80075 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL8P80075 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL8P80075 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCL8P80075 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL8P80075 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL8P80075 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL8P80075 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL8P80075 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL8P80075 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL8P80075 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL8P80075 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCL8P80075 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL8P80075 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL8P80075 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL8P80075 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCL8P80075 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL8P80075 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL8P80075 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL8P80075 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL8P80075 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL8P80075 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL8P80075 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL8P80075 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL8P80075 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCL8P80075 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL8P80075 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL8P80075 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL8P80075 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCL8P80075 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCL8P80075 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCL8P80075 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CCL8P80075 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCL8P80075 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCL8P80075 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL8P80075 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL8P80075 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL8P80075 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL8P80075 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL8P80075 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCL8P80075 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCL8P80075 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCL8P80075 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCL8P80075 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCL8P80075 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCL8P80075 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCL8P80075 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCL8P80075 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCL8P80075 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms