Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPNP63162 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPNP63162 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPNP63162 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.1 ms