Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERVK_113P63121 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63121 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERVK_113P63121 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms