Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP3S2P59780 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms