Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP1S2P56377 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP1S2P56377 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms