Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMTNP53814 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMTNP53814 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMTNP53814 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMTNP53814 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMTNP53814 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMTNP53814 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMTNP53814 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMTNP53814 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMTNP53814 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMTNP53814 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMTNP53814 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMTNP53814 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMTNP53814 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMTNP53814 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMTNP53814 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMTNP53814 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMTNP53814 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMTNP53814 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMTNP53814 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMTNP53814 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMTNP53814 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMTNP53814 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMTNP53814 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMTNP53814 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMTNP53814 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMTNP53814 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMTNP53814 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMTNP53814 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMTNP53814 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMTNP53814 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMTNP53814 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMTNP53814 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SMTNP53814 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMTNP53814 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMTNP53814 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMTNP53814 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMTNP53814 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMTNP53814 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SMTNP53814 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMTNP53814 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMTNP53814 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMTNP53814 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMTNP53814 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMTNP53814 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMTNP53814 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMTNP53814 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMTNP53814 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMTNP53814 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMTNP53814 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMTNP53814 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMTNP53814 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SMTNP53814 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMTNP53814 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMTNP53814 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMTNP53814 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMTNP53814 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMTNP53814 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMTNP53814 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMTNP53814 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMTNP53814 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMTNP53814 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMTNP53814 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMTNP53814 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMTNP53814 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMTNP53814 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMTNP53814 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMTNP53814 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMTNP53814 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMTNP53814 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMTNP53814 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMTNP53814 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMTNP53814 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMTNP53814 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMTNP53814 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMTNP53814 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMTNP53814 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMTNP53814 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMTNP53814 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMTNP53814 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMTNP53814 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMTNP53814 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMTNP53814 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMTNP53814 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMTNP53814 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMTNP53814 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMTNP53814 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SMTNP53814 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMTNP53814 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMTNP53814 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMTNP53814 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMTNP53814 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMTNP53814 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMTNP53814 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMTNP53814 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMTNP53814 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMTNP53814 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMTNP53814 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMTNP53814 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SMTNP53814 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms