Protein–RNA interactions for Protein: P51797

CLCN6, Chloride transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN6P51797 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCN6P51797 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCN6P51797 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLCN6P51797 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLCN6P51797 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLCN6P51797 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLCN6P51797 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLCN6P51797 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLCN6P51797 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLCN6P51797 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLCN6P51797 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLCN6P51797 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLCN6P51797 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms