Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSMB2P49721 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB2P49721 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms