Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSN1S1P47710 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSN1S1P47710 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSN1S1P47710 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSN1S1P47710 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSN1S1P47710 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSN1S1P47710 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSN1S1P47710 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSN1S1P47710 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms