Protein–RNA interactions for Protein: P40855

PEX19, Peroxisomal biogenesis factor 19, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX19P40855 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX19P40855 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX19P40855 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX19P40855 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX19P40855 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX19P40855 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX19P40855 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX19P40855 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX19P40855 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX19P40855 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX19P40855 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX19P40855 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX19P40855 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX19P40855 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX19P40855 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX19P40855 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX19P40855 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX19P40855 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX19P40855 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX19P40855 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX19P40855 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX19P40855 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX19P40855 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX19P40855 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX19P40855 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX19P40855 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX19P40855 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX19P40855 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX19P40855 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX19P40855 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX19P40855 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX19P40855 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PEX19P40855 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX19P40855 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX19P40855 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX19P40855 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX19P40855 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX19P40855 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX19P40855 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX19P40855 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PEX19P40855 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX19P40855 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX19P40855 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX19P40855 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX19P40855 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX19P40855 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX19P40855 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX19P40855 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX19P40855 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX19P40855 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX19P40855 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX19P40855 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PEX19P40855 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX19P40855 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX19P40855 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX19P40855 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX19P40855 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX19P40855 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX19P40855 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX19P40855 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PEX19P40855 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX19P40855 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX19P40855 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX19P40855 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX19P40855 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX19P40855 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PEX19P40855 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX19P40855 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX19P40855 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX19P40855 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX19P40855 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX19P40855 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX19P40855 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX19P40855 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PEX19P40855 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX19P40855 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX19P40855 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX19P40855 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX19P40855 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX19P40855 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX19P40855 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX19P40855 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX19P40855 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PEX19P40855 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX19P40855 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX19P40855 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PEX19P40855 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX19P40855 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX19P40855 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX19P40855 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX19P40855 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX19P40855 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX19P40855 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX19P40855 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX19P40855 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX19P40855 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX19P40855 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PEX19P40855 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PEX19P40855 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PEX19P40855 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms