Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARL1P40616 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARL1P40616 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARL1P40616 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARL1P40616 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARL1P40616 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARL1P40616 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARL1P40616 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARL1P40616 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARL1P40616 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARL1P40616 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARL1P40616 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARL1P40616 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARL1P40616 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARL1P40616 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARL1P40616 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARL1P40616 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARL1P40616 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARL1P40616 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARL1P40616 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARL1P40616 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARL1P40616 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARL1P40616 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARL1P40616 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARL1P40616 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARL1P40616 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARL1P40616 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARL1P40616 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARL1P40616 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARL1P40616 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARL1P40616 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARL1P40616 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARL1P40616 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARL1P40616 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARL1P40616 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARL1P40616 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARL1P40616 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL1P40616 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL1P40616 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL1P40616 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL1P40616 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL1P40616 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL1P40616 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL1P40616 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL1P40616 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARL1P40616 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARL1P40616 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARL1P40616 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARL1P40616 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARL1P40616 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARL1P40616 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL1P40616 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL1P40616 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL1P40616 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL1P40616 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL1P40616 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL1P40616 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL1P40616 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL1P40616 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARL1P40616 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL1P40616 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL1P40616 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL1P40616 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL1P40616 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARL1P40616 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARL1P40616 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARL1P40616 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARL1P40616 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARL1P40616 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARL1P40616 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARL1P40616 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARL1P40616 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARL1P40616 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARL1P40616 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARL1P40616 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARL1P40616 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARL1P40616 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARL1P40616 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARL1P40616 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARL1P40616 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARL1P40616 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARL1P40616 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARL1P40616 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARL1P40616 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARL1P40616 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARL1P40616 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARL1P40616 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARL1P40616 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARL1P40616 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARL1P40616 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARL1P40616 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARL1P40616 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARL1P40616 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARL1P40616 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARL1P40616 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARL1P40616 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARL1P40616 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARL1P40616 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARL1P40616 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARL1P40616 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms