Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX5P35711 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX5P35711 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX5P35711 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX5P35711 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX5P35711 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX5P35711 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX5P35711 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX5P35711 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX5P35711 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX5P35711 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX5P35711 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX5P35711 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX5P35711 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX5P35711 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX5P35711 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX5P35711 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX5P35711 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX5P35711 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX5P35711 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX5P35711 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX5P35711 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX5P35711 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX5P35711 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX5P35711 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX5P35711 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX5P35711 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX5P35711 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX5P35711 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX5P35711 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SOX5P35711 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SOX5P35711 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX5P35711 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX5P35711 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX5P35711 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX5P35711 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX5P35711 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX5P35711 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX5P35711 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX5P35711 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX5P35711 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX5P35711 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX5P35711 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX5P35711 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX5P35711 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX5P35711 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX5P35711 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX5P35711 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX5P35711 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX5P35711 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX5P35711 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX5P35711 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX5P35711 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX5P35711 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX5P35711 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX5P35711 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX5P35711 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX5P35711 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX5P35711 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX5P35711 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX5P35711 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX5P35711 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX5P35711 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX5P35711 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX5P35711 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX5P35711 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX5P35711 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX5P35711 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX5P35711 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX5P35711 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX5P35711 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX5P35711 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX5P35711 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SOX5P35711 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SOX5P35711 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SOX5P35711 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX5P35711 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX5P35711 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX5P35711 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX5P35711 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX5P35711 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX5P35711 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX5P35711 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX5P35711 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX5P35711 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX5P35711 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX5P35711 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SOX5P35711 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX5P35711 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX5P35711 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX5P35711 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX5P35711 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SOX5P35711 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX5P35711 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX5P35711 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX5P35711 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX5P35711 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX5P35711 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOX5P35711 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SOX5P35711 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms