Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
DDIT3P35638 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DDIT3P35638 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDIT3P35638 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms