Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTNNB1P35222 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTNNB1P35222 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTNNB1P35222 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms