Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTF4P34130 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTF4P34130 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTF4P34130 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTF4P34130 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTF4P34130 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NTF4P34130 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTF4P34130 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTF4P34130 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTF4P34130 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTF4P34130 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTF4P34130 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTF4P34130 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NTF4P34130 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NTF4P34130 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NTF4P34130 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NTF4P34130 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NTF4P34130 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NTF4P34130 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTF4P34130 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTF4P34130 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NTF4P34130 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTF4P34130 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTF4P34130 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTF4P34130 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTF4P34130 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTF4P34130 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTF4P34130 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NTF4P34130 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NTF4P34130 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTF4P34130 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTF4P34130 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTF4P34130 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NTF4P34130 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTF4P34130 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTF4P34130 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NTF4P34130 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTF4P34130 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTF4P34130 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTF4P34130 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTF4P34130 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTF4P34130 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NTF4P34130 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTF4P34130 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTF4P34130 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTF4P34130 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTF4P34130 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTF4P34130 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NTF4P34130 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTF4P34130 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTF4P34130 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTF4P34130 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTF4P34130 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NTF4P34130 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTF4P34130 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTF4P34130 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTF4P34130 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NTF4P34130 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NTF4P34130 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTF4P34130 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTF4P34130 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTF4P34130 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTF4P34130 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTF4P34130 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NTF4P34130 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NTF4P34130 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NTF4P34130 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTF4P34130 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTF4P34130 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTF4P34130 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTF4P34130 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTF4P34130 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTF4P34130 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NTF4P34130 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NTF4P34130 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NTF4P34130 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NTF4P34130 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NTF4P34130 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NTF4P34130 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NTF4P34130 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NTF4P34130 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NTF4P34130 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTF4P34130 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTF4P34130 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTF4P34130 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTF4P34130 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTF4P34130 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTF4P34130 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NTF4P34130 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NTF4P34130 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTF4P34130 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTF4P34130 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTF4P34130 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTF4P34130 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTF4P34130 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTF4P34130 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NTF4P34130 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NTF4P34130 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NTF4P34130 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NTF4P34130 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms