Protein–RNA interactions for Protein: P27694

RPA1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA1P27694 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPA1P27694 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPA1P27694 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPA1P27694 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPA1P27694 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPA1P27694 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPA1P27694 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPA1P27694 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RPA1P27694 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPA1P27694 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPA1P27694 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPA1P27694 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPA1P27694 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RPA1P27694 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RPA1P27694 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPA1P27694 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPA1P27694 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPA1P27694 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPA1P27694 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPA1P27694 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPA1P27694 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPA1P27694 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPA1P27694 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPA1P27694 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPA1P27694 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPA1P27694 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPA1P27694 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPA1P27694 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPA1P27694 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPA1P27694 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPA1P27694 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPA1P27694 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPA1P27694 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPA1P27694 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPA1P27694 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPA1P27694 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPA1P27694 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPA1P27694 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPA1P27694 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPA1P27694 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPA1P27694 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPA1P27694 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPA1P27694 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPA1P27694 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPA1P27694 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPA1P27694 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPA1P27694 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPA1P27694 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPA1P27694 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RPA1P27694 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPA1P27694 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPA1P27694 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPA1P27694 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RPA1P27694 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPA1P27694 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RPA1P27694 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPA1P27694 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPA1P27694 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPA1P27694 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPA1P27694 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPA1P27694 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPA1P27694 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPA1P27694 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPA1P27694 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPA1P27694 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RPA1P27694 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPA1P27694 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPA1P27694 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPA1P27694 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPA1P27694 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPA1P27694 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPA1P27694 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPA1P27694 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPA1P27694 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPA1P27694 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RPA1P27694 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPA1P27694 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RPA1P27694 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPA1P27694 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPA1P27694 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPA1P27694 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPA1P27694 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPA1P27694 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPA1P27694 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPA1P27694 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPA1P27694 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPA1P27694 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPA1P27694 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPA1P27694 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPA1P27694 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPA1P27694 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPA1P27694 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPA1P27694 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPA1P27694 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPA1P27694 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPA1P27694 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPA1P27694 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPA1P27694 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPA1P27694 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPA1P27694 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 260.9 ms