Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BGNP21810 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BGNP21810 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BGNP21810 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BGNP21810 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BGNP21810 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BGNP21810 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BGNP21810 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BGNP21810 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BGNP21810 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BGNP21810 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BGNP21810 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BGNP21810 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BGNP21810 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BGNP21810 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BGNP21810 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BGNP21810 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BGNP21810 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BGNP21810 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BGNP21810 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BGNP21810 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BGNP21810 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BGNP21810 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BGNP21810 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BGNP21810 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BGNP21810 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BGNP21810 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BGNP21810 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BGNP21810 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BGNP21810 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BGNP21810 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BGNP21810 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BGNP21810 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BGNP21810 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BGNP21810 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BGNP21810 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BGNP21810 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BGNP21810 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BGNP21810 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BGNP21810 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BGNP21810 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BGNP21810 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BGNP21810 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BGNP21810 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BGNP21810 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BGNP21810 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BGNP21810 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BGNP21810 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BGNP21810 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BGNP21810 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BGNP21810 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BGNP21810 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BGNP21810 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BGNP21810 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BGNP21810 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BGNP21810 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BGNP21810 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BGNP21810 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BGNP21810 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BGNP21810 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BGNP21810 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BGNP21810 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BGNP21810 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BGNP21810 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BGNP21810 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BGNP21810 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BGNP21810 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BGNP21810 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BGNP21810 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BGNP21810 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BGNP21810 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BGNP21810 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BGNP21810 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BGNP21810 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BGNP21810 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BGNP21810 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BGNP21810 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BGNP21810 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BGNP21810 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BGNP21810 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BGNP21810 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BGNP21810 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BGNP21810 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BGNP21810 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BGNP21810 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BGNP21810 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BGNP21810 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BGNP21810 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BGNP21810 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BGNP21810 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BGNP21810 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BGNP21810 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BGNP21810 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BGNP21810 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BGNP21810 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BGNP21810 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BGNP21810 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BGNP21810 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BGNP21810 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BGNP21810 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms