Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCLP19338 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCLP19338 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCLP19338 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCLP19338 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NCLP19338 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
NCLP19338 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NCLP19338 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCLP19338 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCLP19338 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCLP19338 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCLP19338 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCLP19338 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCLP19338 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCLP19338 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCLP19338 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NCLP19338 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCLP19338 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCLP19338 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCLP19338 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCLP19338 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCLP19338 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCLP19338 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCLP19338 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCLP19338 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCLP19338 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCLP19338 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCLP19338 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCLP19338 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCLP19338 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCLP19338 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCLP19338 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCLP19338 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NCLP19338 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCLP19338 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCLP19338 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCLP19338 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCLP19338 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCLP19338 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCLP19338 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCLP19338 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCLP19338 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCLP19338 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCLP19338 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCLP19338 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCLP19338 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NCLP19338 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NCLP19338 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCLP19338 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCLP19338 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCLP19338 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCLP19338 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCLP19338 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCLP19338 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCLP19338 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCLP19338 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCLP19338 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCLP19338 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCLP19338 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCLP19338 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCLP19338 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCLP19338 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCLP19338 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCLP19338 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NCLP19338 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCLP19338 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NCLP19338 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCLP19338 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCLP19338 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCLP19338 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCLP19338 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCLP19338 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCLP19338 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCLP19338 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCLP19338 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCLP19338 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCLP19338 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCLP19338 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCLP19338 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCLP19338 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCLP19338 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCLP19338 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCLP19338 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NCLP19338 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCLP19338 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCLP19338 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCLP19338 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCLP19338 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCLP19338 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCLP19338 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCLP19338 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCLP19338 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCLP19338 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCLP19338 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCLP19338 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCLP19338 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCLP19338 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCLP19338 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NCLP19338 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCLP19338 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms