Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNNT1P13805 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNT1P13805 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT1P13805 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms