Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT13P13646 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT13P13646 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT13P13646 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT13P13646 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT13P13646 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT13P13646 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT13P13646 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT13P13646 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT13P13646 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT13P13646 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT13P13646 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT13P13646 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT13P13646 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT13P13646 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT13P13646 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT13P13646 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT13P13646 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT13P13646 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT13P13646 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT13P13646 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT13P13646 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT13P13646 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT13P13646 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT13P13646 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT13P13646 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT13P13646 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT13P13646 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT13P13646 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT13P13646 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT13P13646 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT13P13646 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT13P13646 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT13P13646 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT13P13646 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT13P13646 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT13P13646 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KRT13P13646 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT13P13646 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT13P13646 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT13P13646 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT13P13646 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT13P13646 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT13P13646 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT13P13646 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT13P13646 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT13P13646 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT13P13646 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT13P13646 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT13P13646 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT13P13646 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT13P13646 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT13P13646 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT13P13646 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT13P13646 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT13P13646 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT13P13646 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT13P13646 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT13P13646 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT13P13646 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT13P13646 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT13P13646 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT13P13646 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT13P13646 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT13P13646 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT13P13646 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT13P13646 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT13P13646 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT13P13646 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT13P13646 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT13P13646 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT13P13646 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT13P13646 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT13P13646 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT13P13646 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT13P13646 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT13P13646 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT13P13646 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT13P13646 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT13P13646 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT13P13646 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT13P13646 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT13P13646 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT13P13646 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT13P13646 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
KRT13P13646 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
KRT13P13646 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT13P13646 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT13P13646 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT13P13646 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT13P13646 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT13P13646 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT13P13646 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT13P13646 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT13P13646 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT13P13646 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT13P13646 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT13P13646 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT13P13646 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT13P13646 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms