Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAA1P0DJI8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SAA1P0DJI8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAA1P0DJI8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAA1P0DJI8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAA1P0DJI8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAA1P0DJI8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SAA1P0DJI8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SAA1P0DJI8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SAA1P0DJI8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAA1P0DJI8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms