Protein–RNA interactions for Protein: P09430

TNP1, Spermatid nuclear transition protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP1P09430 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP1P09430 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP1P09430 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP1P09430 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP1P09430 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP1P09430 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP1P09430 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP1P09430 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP1P09430 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP1P09430 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP1P09430 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
TNP1P09430 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP1P09430 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP1P09430 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP1P09430 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP1P09430 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP1P09430 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP1P09430 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP1P09430 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP1P09430 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP1P09430 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP1P09430 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP1P09430 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP1P09430 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP1P09430 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP1P09430 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP1P09430 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP1P09430 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP1P09430 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP1P09430 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP1P09430 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TNP1P09430 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TNP1P09430 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TNP1P09430 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TNP1P09430 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TNP1P09430 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TNP1P09430 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TNP1P09430 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TNP1P09430 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TNP1P09430 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP1P09430 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP1P09430 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP1P09430 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP1P09430 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP1P09430 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP1P09430 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP1P09430 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP1P09430 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP1P09430 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP1P09430 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP1P09430 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP1P09430 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP1P09430 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP1P09430 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP1P09430 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP1P09430 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP1P09430 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP1P09430 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP1P09430 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP1P09430 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP1P09430 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP1P09430 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP1P09430 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP1P09430 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP1P09430 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP1P09430 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP1P09430 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP1P09430 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP1P09430 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TNP1P09430 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP1P09430 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP1P09430 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP1P09430 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP1P09430 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP1P09430 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP1P09430 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP1P09430 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP1P09430 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP1P09430 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP1P09430 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP1P09430 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP1P09430 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP1P09430 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP1P09430 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP1P09430 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP1P09430 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP1P09430 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP1P09430 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP1P09430 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP1P09430 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP1P09430 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP1P09430 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP1P09430 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP1P09430 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP1P09430 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TNP1P09430 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TNP1P09430 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TNP1P09430 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TNP1P09430 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TNP1P09430 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms