Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALB1P05937 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALB1P05937 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALB1P05937 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALB1P05937 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CALB1P05937 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALB1P05937 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALB1P05937 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALB1P05937 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CALB1P05937 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALB1P05937 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CALB1P05937 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CALB1P05937 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALB1P05937 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALB1P05937 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALB1P05937 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CALB1P05937 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALB1P05937 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALB1P05937 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALB1P05937 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALB1P05937 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALB1P05937 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALB1P05937 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALB1P05937 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALB1P05937 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALB1P05937 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALB1P05937 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALB1P05937 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALB1P05937 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALB1P05937 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CALB1P05937 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALB1P05937 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALB1P05937 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALB1P05937 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CALB1P05937 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALB1P05937 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALB1P05937 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALB1P05937 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALB1P05937 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALB1P05937 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CALB1P05937 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALB1P05937 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALB1P05937 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALB1P05937 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALB1P05937 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALB1P05937 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CALB1P05937 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CALB1P05937 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALB1P05937 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALB1P05937 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CALB1P05937 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALB1P05937 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALB1P05937 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALB1P05937 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CALB1P05937 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CALB1P05937 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALB1P05937 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALB1P05937 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CALB1P05937 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CALB1P05937 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CALB1P05937 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CALB1P05937 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALB1P05937 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALB1P05937 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CALB1P05937 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALB1P05937 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALB1P05937 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALB1P05937 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALB1P05937 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALB1P05937 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALB1P05937 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALB1P05937 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALB1P05937 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALB1P05937 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALB1P05937 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALB1P05937 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALB1P05937 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALB1P05937 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALB1P05937 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALB1P05937 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALB1P05937 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALB1P05937 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALB1P05937 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALB1P05937 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALB1P05937 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALB1P05937 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CALB1P05937 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CALB1P05937 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALB1P05937 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALB1P05937 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALB1P05937 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALB1P05937 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALB1P05937 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CALB1P05937 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALB1P05937 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CALB1P05937 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALB1P05937 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALB1P05937 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALB1P05937 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALB1P05937 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms