Protein–RNA interactions for Protein: P04278

SHBG, Sex hormone-binding globulin, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBGP04278 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHBGP04278 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHBGP04278 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHBGP04278 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHBGP04278 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHBGP04278 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SHBGP04278 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHBGP04278 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHBGP04278 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHBGP04278 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHBGP04278 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHBGP04278 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHBGP04278 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SHBGP04278 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHBGP04278 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHBGP04278 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHBGP04278 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHBGP04278 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHBGP04278 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHBGP04278 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHBGP04278 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHBGP04278 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHBGP04278 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHBGP04278 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHBGP04278 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SHBGP04278 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHBGP04278 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SHBGP04278 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHBGP04278 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHBGP04278 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHBGP04278 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SHBGP04278 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHBGP04278 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHBGP04278 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHBGP04278 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHBGP04278 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHBGP04278 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHBGP04278 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHBGP04278 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHBGP04278 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHBGP04278 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHBGP04278 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHBGP04278 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHBGP04278 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHBGP04278 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SHBGP04278 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHBGP04278 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHBGP04278 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHBGP04278 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHBGP04278 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHBGP04278 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SHBGP04278 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SHBGP04278 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SHBGP04278 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SHBGP04278 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SHBGP04278 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SHBGP04278 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SHBGP04278 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SHBGP04278 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SHBGP04278 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHBGP04278 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHBGP04278 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SHBGP04278 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SHBGP04278 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHBGP04278 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHBGP04278 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHBGP04278 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SHBGP04278 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHBGP04278 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SHBGP04278 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHBGP04278 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHBGP04278 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHBGP04278 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHBGP04278 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHBGP04278 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SHBGP04278 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHBGP04278 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHBGP04278 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SHBGP04278 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHBGP04278 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHBGP04278 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHBGP04278 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHBGP04278 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SHBGP04278 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHBGP04278 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHBGP04278 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SHBGP04278 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SHBGP04278 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHBGP04278 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHBGP04278 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHBGP04278 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHBGP04278 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SHBGP04278 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SHBGP04278 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SHBGP04278 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHBGP04278 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHBGP04278 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHBGP04278 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SHBGP04278 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SHBGP04278 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms