Protein–RNA interactions for Protein: P03956

MMP1, Interstitial collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP1P03956 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP1P03956 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP1P03956 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP1P03956 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP1P03956 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP1P03956 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MMP1P03956 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MMP1P03956 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MMP1P03956 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MMP1P03956 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MMP1P03956 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MMP1P03956 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP1P03956 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP1P03956 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP1P03956 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP1P03956 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP1P03956 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP1P03956 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP1P03956 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP1P03956 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP1P03956 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP1P03956 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP1P03956 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP1P03956 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP1P03956 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP1P03956 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP1P03956 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP1P03956 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP1P03956 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP1P03956 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP1P03956 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP1P03956 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP1P03956 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP1P03956 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP1P03956 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MMP1P03956 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MMP1P03956 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MMP1P03956 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MMP1P03956 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MMP1P03956 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MMP1P03956 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MMP1P03956 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MMP1P03956 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP1P03956 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP1P03956 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP1P03956 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP1P03956 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP1P03956 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP1P03956 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP1P03956 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP1P03956 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP1P03956 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP1P03956 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP1P03956 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP1P03956 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP1P03956 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP1P03956 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP1P03956 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP1P03956 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP1P03956 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP1P03956 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP1P03956 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP1P03956 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP1P03956 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP1P03956 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP1P03956 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP1P03956 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP1P03956 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MMP1P03956 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MMP1P03956 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MMP1P03956 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MMP1P03956 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MMP1P03956 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMP1P03956 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMP1P03956 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMP1P03956 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMP1P03956 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMP1P03956 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMP1P03956 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMP1P03956 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
MMP1P03956 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MMP1P03956 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MMP1P03956 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MMP1P03956 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MMP1P03956 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MMP1P03956 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MMP1P03956 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MMP1P03956 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MMP1P03956 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MMP1P03956 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MMP1P03956 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MMP1P03956 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MMP1P03956 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MMP1P03956 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MMP1P03956 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MMP1P03956 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MMP1P03956 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MMP1P03956 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MMP1P03956 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MMP1P03956 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms