Protein–RNA interactions for Protein: P03897

MT-ND3, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND3P03897 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MT-ND3P03897 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MT-ND3P03897 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MT-ND3P03897 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MT-ND3P03897 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MT-ND3P03897 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MT-ND3P03897 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MT-ND3P03897 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MT-ND3P03897 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MT-ND3P03897 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MT-ND3P03897 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MT-ND3P03897 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MT-ND3P03897 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms