Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGAP02671 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGAP02671 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGAP02671 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGAP02671 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGAP02671 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
FGAP02671 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGAP02671 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGAP02671 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGAP02671 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGAP02671 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGAP02671 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGAP02671 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FGAP02671 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGAP02671 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGAP02671 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGAP02671 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGAP02671 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGAP02671 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGAP02671 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGAP02671 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGAP02671 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGAP02671 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGAP02671 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGAP02671 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGAP02671 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGAP02671 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGAP02671 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGAP02671 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGAP02671 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGAP02671 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGAP02671 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGAP02671 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGAP02671 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGAP02671 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGAP02671 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGAP02671 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGAP02671 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGAP02671 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGAP02671 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FGAP02671 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FGAP02671 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGAP02671 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGAP02671 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGAP02671 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGAP02671 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGAP02671 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGAP02671 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGAP02671 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGAP02671 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGAP02671 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGAP02671 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FGAP02671 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FGAP02671 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FGAP02671 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FGAP02671 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FGAP02671 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FGAP02671 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGAP02671 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGAP02671 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGAP02671 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FGAP02671 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGAP02671 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGAP02671 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FGAP02671 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FGAP02671 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FGAP02671 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FGAP02671 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FGAP02671 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGAP02671 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGAP02671 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGAP02671 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGAP02671 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGAP02671 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGAP02671 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FGAP02671 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FGAP02671 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FGAP02671 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FGAP02671 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FGAP02671 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FGAP02671 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FGAP02671 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGAP02671 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGAP02671 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGAP02671 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGAP02671 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FGAP02671 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FGAP02671 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FGAP02671 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FGAP02671 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FGAP02671 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FGAP02671 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FGAP02671 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FGAP02671 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FGAP02671 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FGAP02671 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGAP02671 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGAP02671 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGAP02671 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGAP02671 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms