Protein–RNA interactions for Protein: O95947

TBX6, T-box transcription factor TBX6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX6O95947 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBX6O95947 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBX6O95947 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TBX6O95947 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TBX6O95947 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBX6O95947 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBX6O95947 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TBX6O95947 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBX6O95947 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBX6O95947 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBX6O95947 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TBX6O95947 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBX6O95947 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TBX6O95947 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX6O95947 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX6O95947 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX6O95947 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TBX6O95947 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBX6O95947 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBX6O95947 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TBX6O95947 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBX6O95947 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBX6O95947 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBX6O95947 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TBX6O95947 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TBX6O95947 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TBX6O95947 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TBX6O95947 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBX6O95947 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TBX6O95947 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBX6O95947 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBX6O95947 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBX6O95947 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBX6O95947 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBX6O95947 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBX6O95947 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TBX6O95947 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBX6O95947 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBX6O95947 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBX6O95947 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBX6O95947 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBX6O95947 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TBX6O95947 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX6O95947 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX6O95947 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX6O95947 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX6O95947 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX6O95947 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX6O95947 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX6O95947 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX6O95947 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX6O95947 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX6O95947 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX6O95947 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX6O95947 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TBX6O95947 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBX6O95947 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBX6O95947 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBX6O95947 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBX6O95947 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBX6O95947 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBX6O95947 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBX6O95947 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBX6O95947 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBX6O95947 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBX6O95947 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBX6O95947 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TBX6O95947 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX6O95947 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX6O95947 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX6O95947 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX6O95947 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX6O95947 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX6O95947 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TBX6O95947 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBX6O95947 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBX6O95947 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBX6O95947 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBX6O95947 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBX6O95947 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBX6O95947 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBX6O95947 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TBX6O95947 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBX6O95947 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBX6O95947 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBX6O95947 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBX6O95947 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBX6O95947 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBX6O95947 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBX6O95947 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBX6O95947 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TBX6O95947 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBX6O95947 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBX6O95947 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBX6O95947 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TBX6O95947 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TBX6O95947 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TBX6O95947 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TBX6O95947 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TBX6O95947 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms