Protein–RNA interactions for Protein: O75436

VPS26A, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS26AO75436 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS26AO75436 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS26AO75436 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VPS26AO75436 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms