Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
VAMP4O75379 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
VAMP4O75379 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
VAMP4O75379 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
VAMP4O75379 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
VAMP4O75379 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
VAMP4O75379 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
VAMP4O75379 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
VAMP4O75379 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
VAMP4O75379 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
VAMP4O75379 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
VAMP4O75379 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
VAMP4O75379 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
VAMP4O75379 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
VAMP4O75379 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
VAMP4O75379 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
VAMP4O75379 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
VAMP4O75379 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
VAMP4O75379 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
VAMP4O75379 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
VAMP4O75379 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
VAMP4O75379 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
VAMP4O75379 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
VAMP4O75379 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
VAMP4O75379 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
VAMP4O75379 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
VAMP4O75379 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
VAMP4O75379 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
VAMP4O75379 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
VAMP4O75379 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
VAMP4O75379 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
VAMP4O75379 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms